
本文旨在提供一个使用Python从栅格图像中提取多边形区域内NDVI值的实用指南。我们将使用Rasterio和Fiona库,演示如何加载栅格数据和矢量数据,并利用掩膜操作提取特定区域的NDVI平均值。此外,还将介绍如何提取多边形外部的NDVI值,为遥感影像分析提供有效的方法。
从栅格图像中提取多边形区域的NDVI值
本教程将指导您如何使用Python从栅格图像中提取特定多边形区域内的NDVI(归一化植被指数)值。我们将使用 rasterio 和 fiona 这两个强大的库来处理栅格数据和矢量数据。
准备工作
在开始之前,请确保您已安装以下库:
rasterio: 用于读取和写入栅格数据。fiona: 用于读取和写入矢量数据(如Shapefile)。numpy: 用于数值计算。
您可以使用 pip 安装这些库:
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pip install rasterio fiona numpy
步骤详解
导入必要的库
首先,导入所需的库:
import rasterioimport fionaimport rasterio.maskimport numpy as np
加载矢量数据(Shapefile)
使用 fiona 库加载包含多边形边界的Shapefile。假设您的Shapefile文件路径存储在 path_to_shapefile 变量中。
path_to_shapefile = "path/to/your/shapefile.shp" # 替换为你的shapefile路径with fiona.open(path_to_shapefile, "r") as sf: shapes = [feature["geometry"] for feature in sf]
这段代码打开Shapefile,并提取所有要素的几何信息,存储在 shapes 列表中。每个要素的几何信息都表示一个多边形。
加载栅格数据(TIFF)
使用 rasterio 库加载包含NDVI值的栅格图像(通常是TIFF格式)。假设您的TIFF文件路径存储在 source_tif 变量中。
source_tif = "path/to/your/ndvi.tif" # 替换为你的NDVI栅格图像路径with rasterio.open(source_tif) as src: out_image, out_transform = rasterio.mask.mask(src, shapes, crop=True)
这段代码打开TIFF文件,并使用 rasterio.mask.mask 函数提取多边形区域内的栅格数据。crop=True 参数表示裁剪输出图像到多边形边界。out_image 变量包含裁剪后的栅格数据,out_transform 变量包含裁剪后的图像的地理变换信息。
计算NDVI平均值
使用 numpy 库计算提取的NDVI值的平均值。
NDVI_mean = np.mean(out_image)print(f"NDVI 平均值: {NDVI_mean}")
这段代码计算 out_image 中所有像素值的平均值,并将结果打印出来。
提取多边形外部的NDVI值
rasterio.mask.mask 函数还允许您提取多边形外部的像素值。只需将 invert 参数设置为 True 即可。
with rasterio.open(source_tif) as src: out_image, out_transform = rasterio.mask.mask(src, shapes, crop=True, invert=True)NDVI_mean_outside = np.mean(out_image)print(f"多边形外部 NDVI 平均值: {NDVI_mean_outside}")
这段代码提取多边形外部的栅格数据,并计算其平均值。
完整代码示例
以下是一个完整的代码示例,展示了如何从栅格图像中提取多边形区域内和区域外的NDVI平均值:
import rasterioimport fionaimport rasterio.maskimport numpy as np# 定义文件路径path_to_shapefile = "path/to/your/shapefile.shp" # 替换为你的shapefile路径source_tif = "path/to/your/ndvi.tif" # 替换为你的NDVI栅格图像路径# 加载矢量数据with fiona.open(path_to_shapefile, "r") as sf: shapes = [feature["geometry"] for feature in sf]# 提取多边形内部的NDVI值with rasterio.open(source_tif) as src: out_image, out_transform = rasterio.mask.mask(src, shapes, crop=True)NDVI_mean_inside = np.mean(out_image)print(f"多边形内部 NDVI 平均值: {NDVI_mean_inside}")# 提取多边形外部的NDVI值with rasterio.open(source_tif) as src: out_image, out_transform = rasterio.mask.mask(src, shapes, crop=True, invert=True)NDVI_mean_outside = np.mean(out_image)print(f"多边形外部 NDVI 平均值: {NDVI_mean_outside}")
注意事项
确保Shapefile和TIFF文件位于正确的路径。rasterio.mask.mask 函数返回的 out_image 是一个三维数组,其中第一个维度通常是波段数。如果您的栅格图像只有一个波段(例如,NDVI图像),则可以使用 out_image[0] 来访问实际的像素值。如果您的Shapefile包含多个多边形,rasterio.mask.mask 函数将提取所有多边形内的像素值。如果需要提取特定多边形内的像素值,您需要修改 shapes 列表,只包含您感兴趣的多边形的几何信息。在计算平均值之前,建议检查 out_image 中是否存在无效值(例如,NaN)。可以使用 numpy.nanmean 函数来忽略无效值。
总结
本教程介绍了如何使用Python和 rasterio、fiona 库从栅格图像中提取多边形区域内的NDVI值。通过使用 rasterio.mask.mask 函数,您可以轻松地提取特定区域的像素值,并进行后续分析。这种方法在遥感影像分析、土地覆盖分类等领域具有广泛的应用。
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