Python嵌套列表搜索优化:寻找满足特定条件的素数组合

python嵌套列表搜索优化:寻找满足特定条件的素数组合

本文旨在提供一种优化Python代码,以解决在素数列表中搜索满足特定条件的素数组合的问题。通过使用Numba库进行即时编译,并结合并行计算,可以显著提高搜索效率。本文将详细介绍如何使用Numba优化代码,并提供完整的示例代码。

问题描述

我们需要在一个包含2到10万的素数列表中,找到满足以下条件的第一个包含5个素数的集合:

p1 该集合中任意两个素数组合(例如,3和7 => 37和73)也必须是素数sum(p1..p5) 是满足上述条件的素数和的最小值,且大于10万

原始代码在解决这个问题时速度非常慢,因此需要进行优化。

优化方案:使用Numba

Numba是一个Python的即时(JIT)编译器,它可以将Python代码转换为机器码,从而显著提高代码的执行速度。Numba尤其适用于数值计算密集型的代码,例如本例中的素数搜索。

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1. 安装Numba

首先,确保已经安装了Numba。可以使用pip进行安装:

pip install numba

2. 代码优化步骤

以下是使用Numba优化代码的步骤:

a. 导入必要的库

import numpy as npfrom numba import njit, prange

numpy 用于数组操作。numba.njit 用于将Python函数编译为机器码。numba.prange 用于并行循环。

b. 定义素数判断函数

@njitdef prime(a):    if a < 2:        return False    for x in range(2, int(a**0.5) + 1):        if a % x == 0:            return False    return True

使用@njit装饰器告诉Numba编译此函数。

c. 定义字符串转整数函数

@njitdef str_to_int(s):    final_index, result = len(s) - 1, 0    for i, v in enumerate(s):        result += (ord(v) - 48) * (10 ** (final_index - i))    return result

此函数用于将两个素数连接成一个整数,例如将3和7连接成37。

d. 生成素数列表

@njitdef generate_primes(n):    out = []    for i in range(3, n + 1):        if prime(i):            out.append(i)    return out

生成小于n的所有素数。

e. 生成有效的素数组合

@njit(parallel=True)def get_comb(n=100_000):    # generate all primes < n    primes = generate_primes(n)    n_primes = len(primes)    # generate all valid combinations of primes    combs = np.zeros((n_primes, n_primes), dtype=np.uint8)    for i in prange(n_primes):        for j in prange(i + 1, n_primes):            p1, p2 = primes[i], primes[j]            c1 = str_to_int(f"{p1}{p2}")            c2 = str_to_int(f"{p2}{p1}")            if not prime(c1) or not prime(c2):                continue            combs[i, j] = 1    all_combs = []    for i_p1 in prange(0, n_primes):        for i_p2 in prange(i_p1 + 1, n_primes):            if combs[i_p1, i_p2] == 0:                continue            for i_p3 in prange(i_p2 + 1, n_primes):                if combs[i_p1, i_p3] == 0:                    continue                if combs[i_p2, i_p3] == 0:                    continue                for i_p4 in prange(i_p3 + 1, n_primes):                    if combs[i_p1, i_p4] == 0:                        continue                    if combs[i_p2, i_p4] == 0:                        continue                    if combs[i_p3, i_p4] == 0:                        continue                    for i_p5 in prange(i_p4 + 1, n_primes):                        if combs[i_p1, i_p5] == 0:                            continue                        if combs[i_p2, i_p5] == 0:                            continue                        if combs[i_p3, i_p5] == 0:                            continue                        if combs[i_p4, i_p5] == 0:                            continue                        p1, p2, p3, p4, p5 = (                            primes[i_p1],                            primes[i_p2],                            primes[i_p3],                            primes[i_p4],                            primes[i_p5],                        )                        ccomb = np.array([p1, p2, p3, p4, p5], dtype=np.int64)                        if np.sum(ccomb) < n:                            continue                        all_combs.append(ccomb)                        print(ccomb)                        break    return all_combs

@njit(parallel=True) 启用并行计算。prange 用于并行循环,可以显著提高计算速度。首先,生成所有素数小于n的列表。然后,生成所有有效的素数组合,存储在combs数组中。最后,遍历所有可能的素数组合,找到满足条件的第一个组合。

f. 找到最小的素数组合

all_combs = np.array(get_comb())print()print("Minimal combination:")print(all_combs[np.sum(all_combs, axis=1).argmin()])

计算所有素数组合的和,并找到最小的和对应的组合。

3. 完整代码

import numpy as npfrom numba import njit, prange@njitdef prime(a):    if a < 2:        return False    for x in range(2, int(a**0.5) + 1):        if a % x == 0:            return False    return True@njitdef str_to_int(s):    final_index, result = len(s) - 1, 0    for i, v in enumerate(s):        result += (ord(v) - 48) * (10 ** (final_index - i))    return result@njitdef generate_primes(n):    out = []    for i in range(3, n + 1):        if prime(i):            out.append(i)    return out@njit(parallel=True)def get_comb(n=100_000):    # generate all primes < n    primes = generate_primes(n)    n_primes = len(primes)    # generate all valid combinations of primes    combs = np.zeros((n_primes, n_primes), dtype=np.uint8)    for i in prange(n_primes):        for j in prange(i + 1, n_primes):            p1, p2 = primes[i], primes[j]            c1 = str_to_int(f"{p1}{p2}")            c2 = str_to_int(f"{p2}{p1}")            if not prime(c1) or not prime(c2):                continue            combs[i, j] = 1    all_combs = []    for i_p1 in prange(0, n_primes):        for i_p2 in prange(i_p1 + 1, n_primes):            if combs[i_p1, i_p2] == 0:                continue            for i_p3 in prange(i_p2 + 1, n_primes):                if combs[i_p1, i_p3] == 0:                    continue                if combs[i_p2, i_p3] == 0:                    continue                for i_p4 in prange(i_p3 + 1, n_primes):                    if combs[i_p1, i_p4] == 0:                        continue                    if combs[i_p2, i_p4] == 0:                        continue                    if combs[i_p3, i_p4] == 0:                        continue                    for i_p5 in prange(i_p4 + 1, n_primes):                        if combs[i_p1, i_p5] == 0:                            continue                        if combs[i_p2, i_p5] == 0:                            continue                        if combs[i_p3, i_p5] == 0:                            continue                        if combs[i_p4, i_p5] == 0:                            continue                        p1, p2, p3, p4, p5 = (                            primes[i_p1],                            primes[i_p2],                            primes[i_p3],                            primes[i_p4],                            primes[i_p5],                        )                        ccomb = np.array([p1, p2, p3, p4, p5], dtype=np.int64)                        if np.sum(ccomb) < n:                            continue                        all_combs.append(ccomb)                        print(ccomb)                        break    return all_combsall_combs = np.array(get_comb())print()print("Minimal combination:")print(all_combs[np.sum(all_combs, axis=1).argmin()])

4. 运行结果

在AMD 5700X CPU上,该代码可以在1分20秒内完成计算。

[    3 28277 44111 70241 78509][    7    61 25939 26893 63601][    7    61 25939 61417 63601]                     [    7    61 25939 61471 86959]                     [    7  2467 24847 55213 92593]                     [    7  3361 30757 49069 57331]                ...[ 1993 12823 35911 69691 87697][ 2287  4483  6793 27823 67723][ 3541  9187 38167 44257 65677]Minimal combination:                                [   13   829  9091 17929 72739]real    1m20,599s                                   user    0m0,011s                                    sys     0m0,008s                                    

注意事项

Numba在第一次运行时需要编译代码,因此第一次运行可能会比较慢。Numba对某些Python特性支持有限,需要注意代码的兼容性。并行计算可以提高计算速度,但也会增加CPU的负载。

总结

通过使用Numba进行即时编译和并行计算,可以显著提高Python代码的执行速度,特别是在数值计算密集型的任务中。本文提供了一个具体的例子,展示了如何使用Numba优化素数搜索问题,并提供了完整的示例代码。希望本文能帮助读者更好地理解和应用Numba。

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