本教程旨在解决如何在3D NumPy数组中，为每个2D子数组计算其列的均值（忽略NaN值），并使用这些计算出的均值来填充原始数组中的NaN值。文章将详细介绍如何利用np.nanmean函数进行NaN-aware的均值计算，并通过np.newaxis进行数组维度扩展以实现正确的广播操作，最终完成数据的清洗和填充。
问题场景描述
在数据处理中，我们经常会遇到多维数组中包含缺失值（nan）的情况。例如，一个3d numpy数组可能代表了多组（第一维度）2d数据，每组2d数据又包含行和列。我们的目标是针对每一组2d数据，计算其所有列的均值，同时忽略计算中的nan值，然后用这些计算出的列均值来填充原始数组中对应列的nan值。
考虑以下一个形状为(2, 3, 3)的3D NumPy数组作为示例：
import numpy as npa = np.array([[[1, 2, 3], [4, np.nan, 6], [7, 8, 9]], [[11, 12, 13], [14, np.nan, 16], [17, 18, 19]]])print("原始数组形状:", a.shape)print("原始数组:n", a)
输出：
原始数组形状: (2, 3, 3)原始数组: [[[ 1. 2. 3.] [ 4. nan 6.] [ 7. 8. 9.]] [[11. 12. 13.] [14. nan 16.] [17. 18. 19.]]]
在这个数组中，a[0]和a[1]分别代表了两组2D数据。我们希望对a[0]的第二列（索引为1）计算均值，即(2 + 8) / 2 = 5，然后用5填充a[0, 1, 1]处的NaN。同样，对于a[1]的第二列，计算均值(12 + 18) / 2 = 15，并用15填充a[1, 1, 1]处的NaN。
期望的结果数组如下：
[[[ 1., 2., 3.], [ 4., 5., 6.], [ 7., 8., 9.]], [[11., 12., 13.], [14., 15., 16.], [17., 18., 19.]]]
解决方案：使用 np.nanmean 和广播机制
NumPy提供了一个专门用于处理包含NaN值的均值计算函数 np.nanmean()。结合NumPy强大的广播（broadcasting）机制，我们可以高效地实现上述目标。
1. 计算列均值（忽略NaN）
首先，我们需要计算每个2D子数组的列均值。对于一个形状为(dim0, dim1, dim2)的3D数组，如果我们想计算每个dim0切片（即每个2D子数组）的列均值，我们需要指定axis=1。这是因为axis=0代表第一个维度（2D子数组的索引），axis=1代表第二个维度（2D子数组的行索引），axis=2代表第三个维度（2D子数组的列索引）。当我们对axis=1求均值时，它会沿着行方向进行聚合，从而得到每列的均值。
# 计算每个2D子数组的列均值，忽略NaN值# axis=1 表示在第二个维度上进行求均值操作，即对每个2D切片的列求均值means = np.nanmean(a, axis=1)print("n计算出的列均值 (shape: {}):n{}".format(means.shape, means))
输出：
计算出的列均值 (shape: (2, 3)):[[ 4. 5. 6.] [14. 15. 16.]]
这里，means数组的形状是(2, 3)。means[0]对应原始数组a[0]的列均值 [4., 5., 6.]，其中5.是(2+8)/2的结果。means[1]对应a[1]的列均值 [14., 15., 16.]，其中15.是(12+18)/2的结果。
2. 调整均值数组的形状以进行广播
现在我们有了每个2D子数组的列均值，但means的形状是(2, 3)，而原始数组a的形状是(2, 3, 3)。为了使用np.where函数将这些均值正确地广播到原始数组的相应NaN位置，我们需要将means的形状调整为(2, 1, 3)。通过在第二个维度上添加一个新轴（np.newaxis），可以实现这一点。
# 调整均值数组的形状，使其能够正确广播# means[:, np.newaxis, :] 将形状从 (2, 3) 变为 (2, 1, 3)means_reshaped = means[:, np.newaxis, :]print("n重塑后的列均值 (shape: {}):n{}".format(means_reshaped.shape, means_reshaped))
输出：
重塑后的列均值 (shape: (2, 1, 3)):[[[ 4. 5. 6.]] [[14. 15. 16.]]]
现在，means_reshaped的形状是(2, 1, 3)。当它与形状为(2, 3, 3)的原始数组a进行广播操作时：
第一个维度：2 与 2 匹配。第二个维度：1 与 3 匹配（1会被扩展到3）。第三个维度：3 与 3 匹配。这样，每个2D子数组的列均值就能正确地应用到其所有行。
3. 填充NaN值
最后一步是使用np.where()函数来条件性地替换NaN值。np.where(condition, x, y)的含义是：如果condition为真，则取x中的值；否则，取y中的值。
# 使用np.where函数填充NaN值# 如果a中的元素是NaN，则用重塑后的列均值填充；否则保留a中的原始值a_filled = np.where(np.isnan(a), means_reshaped, a)print("n填充NaN后的数组:n", a_filled)
输出：
填充NaN后的数组: [[[ 1. 2. 3.] [ 4. 5. 6.] [ 7. 8. 9.]] [[11. 12. 13.] [14. 15. 16.] [17. 18. 19.]]]
可以看到，原始数组中的NaN值已经被正确地替换为对应列的均值。
完整代码示例
import numpy as np# 原始3D数组，包含NaN值a = np.array([[[1, 2, 3], [4, np.nan, 6], [7, 8, 9]], [[11, 12, 13], [14, np.nan, 16], [17, 18, 19]]])print("原始数组:n", a)print("原始数组形状:", a.shape)# 1. 计算每个2D子数组的列均值，忽略NaN# axis=1 表示在第二个维度上进行求均值，即对每个2D切片的列求均值means = np.nanmean(a, axis=1)print("n计算出的列均值 (shape: {}):n{}".format(means.shape, means))# 2. 调整均值数组的形状以进行广播# np.newaxis 在指定位置插入一个新维度，将 (2, 3) 变为 (2, 1, 3)means_reshaped = means[:, np.newaxis, :]print("n重塑后的列均值 (shape: {}):n{}".format(means_reshaped.shape, means_reshaped))# 3. 使用np.where填充NaN值# 如果a中的元素是NaN，则用重塑后的列均值填充；否则保留a中的原始值a_filled = np.where(np.isnan(a), means_reshaped, a)print("n填充NaN后的数组:n", a_filled)
注意事项与总结
np.nanmean() 的重要性: 当数据中存在NaN值时，使用标准的np.mean()会导致结果为NaN。np.nanmean()则会自动忽略NaN值进行计算，这在数据清洗中非常有用。轴（axis）的理解: 在多维数组操作中，正确理解axis参数至关重要。axis=1在3D数组(dim0, dim1, dim2)中意味着沿着dim1方向（即行方向）进行操作，从而聚合得到每列的结果。广播（Broadcasting）机制: NumPy的广播机制允许不同形状的数组进行算术运算，但前提是它们的维度能够兼容。通过np.newaxis手动扩展维度是实现兼容性的一种常见且强大的方法。在本例中，将(2, 3)的均值数组重塑为(2, 1, 3)是实现正确广播的关键。np.where() 的应用: np.where()是一个非常灵活的函数，可以根据条件进行元素级的选择和替换，是处理条件逻辑的强大工具。
通过掌握np.nanmean()、np.newaxis和np.where()的组合使用，可以高效且优雅地处理NumPy多维数组中包含NaN值的复杂数据清洗和填充任务。
以上就是利用NumPy处理3D数组中包含NaN值的列均值计算与填充的详细内容，更多请关注创想鸟其它相关文章！
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