如何在CNGBdb快速、批量上传数据?试试Aspera吧~ | CNGBdb-Question Time

dr.羊 | 什么是aspera?

Aspera是由IBM公司开发的一款高效数据传输软件,引入了全新的传输技术faspTM,能够不受文件大小、类型、传输距离和网络条件的限制,以最快的速度帮助用户在全球范围内迁移数据。其核心技术fasp传输协议是一种突破性的传输方案,充分利用现有的WAN基础设施和普通硬件,使传输速度比FTP和HTTP快数百倍。

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Aspera命令行数据上传操作指南

2021年7月,CNSA引入了Aspera命令行数据上传功能。

特别说明:此方法目前仅适用于在CNSA批量提交实验/测序数据;在提交数据之前,需先提交项目和样本。

01

安装软件

在上传文件前,您需要安装Aspera Connect。如果您的电脑上尚未安装该软件,请下载并安装Aspera Connect。

安装指南:访问以下网址:https://www.php.cn/link/69929f09452f582fe0ddc6b518b5d91c → 找到IBM Aspera Connect → 点击Download now → 进入Aspera Connect软件下载页面,选择适合Windows、macOS或Linux系统的安装包下载并安装。

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02

获取Aspera账户

如果您是首次使用Aspera,请在CNSA实验/测序批量提交流程页面选择Aspera命令行上传,并点击“申请Aspera账户”按钮以获取Aspera账户及操作说明。

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03

使用Aspera命令行上传数据

您可以通过以下命令使用Aspera命令行上传文件:

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[path/to/ascp/] 是ascp执行程序的路径。不同操作系统的路径不同,例如:

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[path/to/key/file] 必须是密钥文件的绝对路径。例如:/home/keys/aspera.openssh。在数据提交流程中,您可以点击获取密钥文件,下载所需的密钥文件。

[path/to/folder/containing files] 是您需要上传的所有文件的本地路径。

为了便于数据归档,建议使用-d参数为每个新提交创建一个新的子目录,系统将从您提供的-d参数中获取子目录名称(可以使用CNSA提交编号)。

例如: -d D:workCNSAsub000001

这将创建名为sub000001的子目录,您上传的所有文件都将存放在该子目录中。

[aspera_account] 是系统分配的Aspera账户名,您可以在实验/测序数据提交流程中获取。

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