异常序列
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Python怎样检测基因测序数据中的异常序列片段?
python通过biopython等库和统计方法检测基因测序异常序列,核心步骤包括:1.数据预处理,使用biopython处理fastq/fasta格式数据;2.调用bowtie2或bwa进行序列比对;3.分析覆盖度识别异常区域;4.采用泊松或负二项分布建模并计算p值;5.依据阈值识别异常片段;6.…
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python通过biopython等库和统计方法检测基因测序异常序列,核心步骤包括:1.数据预处理,使用biopython处理fastq/fasta格式数据;2.调用bowtie2或bwa进行序列比对;3.分析覆盖度识别异常区域;4.采用泊松或负二项分布建模并计算p值;5.依据阈值识别异常片段;6.…