Pandas DataFrame超宽结构重塑:从扁平化JSON到规范化多表

Pandas DataFrame超宽结构重塑:从扁平化JSON到规范化多表

本文详细介绍了如何使用Pandas处理由扁平化JSON数据导致的超宽DataFrame。通过melt()函数将宽格式数据转换为长格式,并结合字符串解析与pivot_table()实现数据重构,从而将嵌套结构拆分为更易于分析的规范化表格,有效解决列数过多的问题。

1. 引言:超宽DataFrame的挑战与数据重构需求

在数据处理过程中,我们经常会遇到从扁平化(flattened)的json或类似结构中加载数据到pandas dataframe的情况。当原始json包含多层嵌套的列表或字典,并且这些嵌套结构被展开为独立的列时,dataframe的列数可能会急剧增加,甚至超过1024列,这不仅使得数据难以直观理解和分析,也可能导致性能问题。例如,一个包含多个员工信息(每个员工有工资、多个技能id)的json,在扁平化后可能产生诸如employee_0_salary, employee_0_skills_0_id, employee_0_skills_1_id, employee_1_salary等大量列。

我们的目标是将这种超宽的DataFrame重构为更合理、更规范的格式,例如,将每个员工的信息拆分成独立的行,形成一个包含id、员工索引、工资、技能ID等列的表格,从而便于后续的数据分析和处理。

2. 核心工具:pandas.melt()实现宽到长转换

解决超宽DataFrame问题的首要步骤是将其从宽格式(wide format)转换为长格式(long format)。Pandas库中的melt()函数是实现这一转换的强大工具。melt()函数可以将DataFrame中的一列或多列“融化”为两列:一列存储原始的列名(通常命名为variable),另一列存储对应的值(通常命名为value)。

2.1 melt()函数详解

id_vars: 一个列表,指定哪些列是标识符变量,它们在转换后会保持不变,作为新的长格式DataFrame的标识列。value_vars: 一个列表,指定哪些列是要被“融化”的变量。如果省略此参数,melt()将融化所有非id_vars的列。var_name: 一个字符串,用于指定存储原始列名的新列的名称(默认为variable)。value_name: 一个字符串,用于指定存储原始列值的新列的名称(默认为value)。

2.2 示例:应用melt()

假设我们有以下一个模拟的超宽DataFrame:

import pandas as pd# 模拟超宽DataFramedf = pd.DataFrame({    'id': [1, 2, 1],    'name': ['joe','sue', 'fred'],    'employee_0_salary': [30000, 35000, 40000],    'employee_0_skills_0_id': [101, 102, 103],    'employee_0_skills_1_id': [103, 104, 105],    'employee_1_salary': [32000, 36000, 37000],    'employee_1_skills_0_id': [105, 106, 107],    'employee_1_skills_1_id': [108, 109, 110], # 增加一个技能列以便后续演示})print("原始DataFrame:")print(df)

输出:

原始DataFrame:   id  name  employee_0_salary  employee_0_skills_0_id  employee_0_skills_1_id  employee_1_salary  employee_1_skills_0_id  employee_1_skills_1_id0   1   joe              30000                     101                     103              32000                     105                     1081   2   sue              35000                     102                     104              36000                     106                     1092   1  fred              40000                     103                     105              37000                     107                     110

现在,我们使用melt()函数将其转换为长格式。我们将id和name作为标识符变量:

meltdf = df.melt(id_vars=['id', 'name'])print("n使用melt()转换后的DataFrame:")print(meltdf.head(10)) # 只显示前10行

输出:

使用melt()转换后的DataFrame:   id  name                variable  value0   1   joe       employee_0_salary  300001   2   sue       employee_0_salary  350002   1  fred       employee_0_salary  400003   1   joe  employee_0_skills_0_id    1014   2   sue  employee_0_skills_0_id    1025   1  fred  employee_0_skills_0_id    1036   1   joe  employee_0_skills_1_id    1037   2   sue  employee_0_skills_1_id    1048   1  fred  employee_0_skills_1_id    1059   1   joe       employee_1_salary  32000

可以看到,原始的员工相关列被“融化”成了variable和value两列。

3. 解析variable列:提取嵌套实体信息

melt操作后,所有的关键嵌套信息(例如“哪个员工”和“哪个属性”)都被编码在variable列的字符串中。我们需要从这些字符串中提取结构化的信息,例如员工的索引(0, 1, …)和具体的属性名称(salary, skills_0_id, skills_1_id)。

这通常可以通过字符串操作或正则表达式来完成。考虑到列名模式通常是employee_X_attribute_Y,我们可以使用正则表达式来精确提取。

# 使用正则表达式从variable列中提取员工索引和属性名称# 模式:'employee_(d+)_(.*)' 匹配 'employee_' 后跟数字(员工索引),再跟 '_' 后所有内容(属性名称)extracted_data = meltdf['variable'].str.extract(r'employee_(d+)_(.*)')# 将提取的数据添加到meltdf中,并命名新列meltdf['employee_idx'] = extracted_data[0].astype(int) # 员工索引meltdf['attribute'] = extracted_data[1] # 属性名称print("n解析variable列后的DataFrame:")print(meltdf.head(10))

输出:

解析variable列后的DataFrame:   id  name                variable  value  employee_idx      attribute0   1   joe       employee_0_salary  30000             0         salary1   2   sue       employee_0_salary  35000             0         salary2   1  fred       employee_0_salary  40000             0         salary3   1   joe  employee_0_skills_0_id    101             0  skills_0_id4   2   sue  employee_0_skills_0_id    102             0  skills_0_id5   1  fred  employee_0_skills_0_id    103             0  skills_0_id6   1   joe  employee_0_skills_1_id    103             0  skills_1_id7   2   sue  employee_0_skills_1_id    104             0  skills_1_id8   1  fred  employee_0_skills_1_id    105             0  skills_1_id9   1   joe       employee_1_salary  32000             1         salary

现在,meltdf中有了id、name、employee_idx、attribute和value这些列,数据结构变得清晰。

4. 使用pivot_table()重塑数据:构建规范化表格

有了id、name、employee_idx、attribute和value这些列,我们就可以使用pivot_table()函数将数据重塑为最终的目标格式:每行代表一个员工的详细信息。

pivot_table()函数与pivot()类似,但功能更强大,可以处理重复索引,并支持聚合功能。在这里,我们希望以id、name和employee_idx作为新的行标识符,以attribute作为新的列名,并以value填充单元格。

# 使用pivot_table将数据重塑为每行一个员工的格式# index: 定义新DataFrame的行索引# columns: 定义新DataFrame的列名# values: 定义填充单元格的值normalized_df = meltdf.pivot_table(    index=['id', 'name', 'employee_idx'],    columns='attribute',    values='value')# 重置索引,将id, name, employee_idx从MultiIndex转换为普通列normalized_df = normalized_df.reset_index()# 清理列名:pivot_table后columns会变成MultiIndex,需要扁平化normalized_df.columns.name = None # 移除columns的名称# 如果需要,可以进一步重命名列# normalized_df = normalized_df.rename(columns={'skills_0_id': 'skill_id_0', 'skills_1_id': 'skill_id_1'})print("n最终规范化后的DataFrame:")print(normalized_df)

输出:

最终规范化后的DataFrame:   id  name  employee_idx  salary  skills_0_id  skills_1_id0   1   fred             0   40000          103          1051   1   fred             1   37000          107          1102   1    joe             0   30000          101          1033   1    joe             1   32000          105          1084   2    sue             0   35000          102          1045   2    sue             1   36000          106          109

现在,我们成功地将一个超宽的DataFrame转换成了一个更易于管理和分析的规范化表格。每一行代表一个特定的员工(由id和employee_idx共同标识),其工资和技能ID都作为独立的列呈现。

5. 注意事项与最佳实践

列名模式的统一性: 这种重构方法高度依赖于原始DataFrame列名的一致性和可解析性。确保所有需要重构的列都遵循相同的命名模式(如entity_index_attribute)。数据类型转换: melt()操作会将value列的数据类型统一为object,因为原始列可能包含不同类型的数据。在pivot_table()之后,可能需要手动将相关列(如salary, skills_id)转换回数值类型,例如normalized_df[‘salary’] = pd.to_numeric(normalized_df[‘salary’])。性能考量: 对于包含数百万行或更多数据的超大型DataFrame,melt()和pivot_table()操作可能会消耗大量内存和CPU资源。在这种情况下,可以考虑使用Dask DataFrame进行分布式计算,或者分块处理数据。

以上就是Pandas DataFrame超宽结构重塑:从扁平化JSON到规范化多表的详细内容,更多请关注创想鸟其它相关文章!

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