图像分割预处理简单实用技巧

本文记录图像分割预处理知识,面向新手。先说明目标检测、分类与分割的labels差异,解释分割mask因0、1取值显纯黑,可转为0、255显示。接着介绍mask“显形”“勾勒形状”“图像融合”“简单上色”及“还原色彩”的方法,附具体代码,还拓展了三通道分离知识,助新手理解。

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图像分割预处理简单实用技巧 - 创想鸟

前言

前段时间参加了一个图像的分割比赛,因为是刚接触图像分割这一块,所以很多东西都不太懂得。搞完比赛后,就来写一个项目记录一下,方便像我这样的小白更好的理解一下图像分割预处理的一下小知识。

一些小小知识点

目标检测的labels对应的目标的类别与bbox的坐标参数

图像分类的labels对应就是文件名字的类别

而图像分割的labels对应的就是该物体的轮廓

相信很多小伙伴刚接触图像分割会遇到这样的情况,看了原图之后,再看原图对应的labels,发现是一张纯黑的图片(黑人问号脸?)。连图像的labels都看不到,那还怎么进行后面的研究呢。实际上这是因为图片的labels只用了0,1的取值所以看起来纯黑的图片,通常解决的办法是我们会把labels的取值1变成255;即把0,1二值变成0,255二值。 处理之后,就可以看到labels变成一张黑白的图片。

接下来就是介绍如何把一张labels“纯黑”的图片变成“黑白”图片

图像分割中我习惯labels称作为mask,因此后面的labels就当做是mask方便理解

一、mask之“显形”

PS:数据来源于胸部x光肺部分割数据,并进行了一定的处理后再展示使用。【部分展示】

我们来看原图

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再看mask(0,1取值)

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一片漆黑,啥也看不到,都不知道它分割的是哪部分。为了把mask“显形”就可以通过下面的程序进行处理,处理后就会变成这样的结果。经处理后我们就可以清晰看到原图的mask的到底是哪一部分

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In [5]

#导入必要的包import PIL.Image as Imagefrom tqdm import tqdmimport numpy as npimport osimport timedata_path='HB_data/mask'#原图对应的mask图——0,1二值的黑色图片data_path2='HB_data/c_mask'#保存mask图——0,255二值的黑白图片for _, _, files in os.walk(data_path):    #批量化处理        for f in tqdm(files):            img = Image.open(os.path.join(data_path, f))            img = np.asarray(img).copy()            # print(img)            img[img ==1 ] = 255            # print(img)            img = Image.fromarray(img)            img.save(os.path.join(data_path2, f))

       

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其实原理还是比较简单的,就是用了numpy函数把图片数据弄成矩阵的数值,把矩阵里面为1的数值转化为255,然后再变成图片的数据便可显示。

另外如果想把0,255二值“黑白”照片变成0,1二值“纯黑”照片,可以把上面的1,255互换位置即可

mask显示出来了,但是要原图还有mask来回切换会显得有点不方便,看的有点眼花缭乱,要是图片里面种类多而且目标小,很难可以对的上。因此我们需要把原图和mask合并在一张图上,就是把mask的形状在原图“勾勒”出来。接下来就介绍如何“勾勒形状”。

二、mask之“勾勒形状”

这里我们使用的数据是眼底血管语义分割数据集,并进行了一定的处理。【部分展示】

Tips:这里我们使用的mask是0,255二值。原数据集是0,1二值,可以执行完第一步后再进行进行这一步。这里需要注意一个问题是,原图与mask都是要相同的数据格式才可以展示出来,如果格式不匹配就显示不出来效果

原图:

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对应的mask:

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“勾勒出形状”–mask映射回原图:

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函数cv2.findContours(image, mode, method[, offset])

概述:寻找一个二值图像的轮廓。注意黑色表示背景,白色表示物体,即在黑色背景里寻找白色物体的轮廓

参数:

image:8位单通道图像。非零像素值视为1,所以图像视作二值图像mode:轮廓检索的方式cv2.RETR_EXTERNAL:只检索外部轮廓cv2.RETR_LIST: 检测所有轮廓且不建立层次结构cv2.RETR_CCOMP: 检测所有轮廓,建立两级层次结构cv2.RETR_TREE: 检测所有轮廓,建立完整的层次结构

       

method:轮廓近似的方法cv2.CHAIN_APPROX_NONE:存储所有的轮廓点cv2.CHAIN_APPROX_SIMPLE:压缩水平,垂直和对角线段,只留下端点。 例如矩形轮廓可以用4个点编码。cv2.CHAIN_APPROX_TC89_L1,cv2.CHAIN_APPROX_TC89_KCOS:使用Teh-Chini chain近似算法offset:(可选参数)轮廓点的偏移量,格式为tuple,如(-10,10)表示轮廓点沿X负方向偏移10个像素点,沿Y正方向偏移10个像素点

   

函数cv2.drawContours(image, contours, contourIdx, color[, thickness[, lineType[, hierarchy[, maxLevel[, offset]]]])

概述绘制轮廓线或者填充轮廓

参数image:需要绘制轮廓的目标图像,注意会改变原图contours:轮廓点,上述函数cv2.findContours()的第一个返回值contourIdx**:轮廓的索引,表示绘制第几个轮廓,-1表示绘制所有的轮廓color:绘制轮廓的颜色thickness:(可选参数)轮廓线的宽度,-1表示填充lineType:(可选参数)轮廓线型,包括cv2.LINE_4,cv2.LINE_8(默认),cv2.LINE_AA,分别表示4邻域线,8领域线,抗锯齿线(可以更好地显示曲线)hierarchy:(可选参数)层级结构,上述函数cv2.findContours()的第二个返回值,配合maxLevel参数使用maxLevel:(可选参数)等于0表示只绘制指定的轮廓,等于1表示绘制指定轮廓及其下一级子轮廓,等于2表示绘制指定轮廓及其所有子轮廓offset:(可选参数)轮廓点的偏移量

   In [6]

#导入必要的包import cv2import osfrom PIL import Imageimport matplotlib.image as mpimgimport numpy as npimport matplotlib.pyplot as plt from tqdm import tqdmimg_datapath='GL_data/images'#原图mask_datapath='GL_data/mask'#对应的mask-0,255二值for _, _, files in os.walk(img_datapath):  #批量化处理    for f in tqdm(files):        img = cv2.imread(os.path.join(img_datapath, f), 1)        mask = cv2.imread(os.path.join(mask_datapath, f), 0)        contours, _ = cv2.findContours(mask, cv2.RETR_TREE, cv2.CHAIN_APPROX_SIMPLE)#寻找轮廓        cv2.drawContours(img, contours, -1, (0, 0, 255), 2)#绘制轮廓        img = img[:, :, ::-1]        img[..., 2] = np.where(mask == 1, 255, img[..., 2])        # plt.imshow(img)        # plt.show()        img = Image.fromarray(img)        img.save('GL_data/c_img'+'/'+f)#保存“勾勒形状”图片

       

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三、mask之“图像融合”

当然我们还可以使用Opencv:cv2.addWeighted() 图像融合对image和mask进行融合而不进行“勾勒“。融合的方式有两种:一种是OpenCV方式;一种是PIL方式。

下面是融合的效果:

OpenCV方式

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PIL方式

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可以看到其实融合的效果是一样的

In [7]

# OpenCV方式:import cv2import osfrom tqdm import tqdmimg_datapath='RH_data/images'#原图mask_datapath='RH_data/mask'#对应的mask-0,255二值#addWeighted()函数是将两张相同大小,相同类型的图片(叠加)线性融合的函数,可以实现图片的特效。for _, _, files in os.walk(img_datapath):  #批量化处理    for f in tqdm(files):        image = cv2.imread(os.path.join(img_datapath, f))        mask = cv2.imread(os.path.join(mask_datapath, f))        mask_img = cv2.addWeighted(image, 0.7, mask, 0.3, 10) #image的权重为0.7,mask的权重为0.3        #相当于对图片做一个亮度调整,gamma为0的话代表不调整,gamma为10,图片每个像素加上10,相当于提高亮度,这个值也可以是负的,即降低亮度。        cv2.imwrite('RH_data/r_img'+'/'+f, mask_img)

       

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       In [8]

# PIL方式:import cv2import osfrom tqdm import tqdmimport numpy as npfrom PIL import Imageimg_datapath='RH_data/images'#原图mask_datapath='RH_data/mask'#对应的mask-0,255二值for _, _, files in os.walk(img_datapath):  #批量化处理    for f in tqdm(files):        image = Image.open(os.path.join(img_datapath, f))        mask = Image.open(os.path.join(mask_datapath, f))        mask_img = Image.blend(image.convert('RGBA'),                            mask.convert('RGBA'), 0.3) #数值可以自行调整,数值越大,mask占比越大        mask_img.save('RH_data/r_img1'+'/'+f)

       

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四、mask之“简单上色”

我们此前用的分割后的图片都是单通道图像,因此没有色彩。如果要给分割后的图像显示出颜色,那就必须把原来图像的单通道变成三通道,也就是我们常说的rgb通道。首先我们要把单通道改为rgb通道,然后再对我们的rgb通道进行赋值(上色),也就是对我们矩阵里面的数字进行修改即可。

PS:数据来源于胸部x光肺部分割数据,并进行了一定的处理后再展示使用。【部分展示】

原来的mask,(0,255)二值:

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可以根据个人喜好对原来的mask进行上色(如红色,绿色等)

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当然我们也可以改变背景的颜色,例如背景是绿色,目标是红色:

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In [9]

import numpy as npfrom PIL import Imagedef generate_rgb(gray_array):    print('gray_array.shape', gray_array.shape) #打印出灰度图的shape    x, y = gray_array.shape     rgb = np.zeros([x, y, 3], int) #扩充为rgb通道    # gray_array = np.array(gray_array) #化为矩阵形式    for i in range(x):        for j in range(y):            if gray_array[i, j] == 255:  #目标体(原来是白色)                rgb[i, j, 0] = 255       #rgb通道的,r(红色)通道                rgb[i, j, 1] = 0         #rgb通道的,g(绿色)通道                rgb[i, j, 2] = 0         #rgb通道的,b(蓝色)通道#大家可以根据自己喜欢颜色进行对三通道进行赋值(即调色)            if gray_array[i, j] == 0 :   #背景(原来是黑色)                rgb[i, j, 0] = 0         #rgb通道的,r(红色)通道                rgb[i, j, 1] = 255       #rgb通道的,g(绿色)通道                rgb[i, j, 2] = 0         #rgb通道的,b(蓝色)通道        return rgbmask_datapath='color_data/mask'#对应的mask-0,255二值for _, _, files in os.walk(mask_datapath):  #批量化处理    for f in tqdm(files):        source_img = Image.open(os.path.join(mask_datapath, f)) #读取照片        source_img = np.array(source_img)    #化为矩阵        img = generate_rgb(source_img)   #调用generate_rgb函数        img = Image.fromarray(np.uint8(img))        img.save('color_data/color_mask'+'/'+f)

       

  0%|          | 0/1 [00:00<?, ?it/s]

       

gray_array.shape (512, 512)

       

100%|██████████| 1/1 [00:00<00:00,  1.08it/s]0it [00:00, ?it/s]

       

拓展

我们可以把三通道分开来更好了解图像的特征

In [10]

from PIL import Imageimport matplotlib.pyplot as pltimg=Image.open('color_data/color_mask/2.png') #打开图像gray=img.convert('L')   #转换成灰度r,g,b=img.split()   #分离三通道pic=Image.merge('RGB',(r,g,b)) #合并三通道#原图plt.figure("beauty")plt.subplot(2,3,1), plt.title('origin')plt.imshow(img)#plt.axis('off') 坐标轴#python中subplot的用法    subplot是python中子图的绘制 ,subplot(2,3,2)其中是两行三列,2表示绘制第二个#灰度图plt.subplot(2,3,2), plt.title('gray')plt.imshow(gray,cmap='gray'),plt.axis('off')#三通道合并图plt.subplot(2,3,3), plt.title('merge')plt.imshow(pic)plt.axis('off')#只有r通道图,因为上个程序rgb[i, j, 0] 设置了 255的时候为255,0的时候为0 所以就会显示为常用的0,255二值”黑白“图plt.subplot(2,3,4), plt.title('r')plt.imshow(r,cmap='gray')plt.axis('off')#只有g通道图,因为上个程序rgb[i, j, 1] 设置了 255的时候为0,0的时候为255 所以就会和上面r通道的图颜色相反plt.subplot(2,3,5), plt.title('g')plt.imshow(g,cmap='gray')plt.axis('off')#只有b通道图,因为上个程序rgb[i, j, 2] 设置了 255的时候为0,0的时候为0 ,因为取值都为0,所以是一张纯黑的图plt.subplot(2,3,6), plt.title('b')plt.imshow(b,cmap='gray')plt.axis('off')plt.show()

       

               

五、mask之“还原色彩”

把彩色的mask还原成0,255二值“黑白照”

效果如下:

原图:

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转换后:

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In [11]

import matplotlib.pyplot as pltimport cv2import numpy as npcolor_img = cv2.imread("HY_colordata/1.jpg")#彩色照片gray_image = cv2.cvtColor(color_img, cv2.COLOR_BGR2GRAY)#彩色照片转灰度照片gray_image = np.asarray(gray_image).copy()gray_image[gray_image > 100 ] = 255plt.imshow(gray_image,cmap='Greys')plt.show()

       

               

以上就是图像分割预处理简单实用技巧的详细内容,更多请关注创想鸟其它相关文章!

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